Paper list
International journals
- Kazuya Nishimura, Chenyang Wang, Kazuhide Watanabe, Dai Fei Elmer Ker, Ryoma Bise,
"Weakly
Supervised Cell Instance Segmentation under Various Conditions"
, In Medical Image Analysis(MIA), 2021 (医療画像解析世界トップjournal, impact factor).
[K. Nishimura+,
MIA 2021]
International conference
Peer Reviwed Papers
- Kazuya Nishimura, Dai Fei Elmer Ker and Ryoma Bise, "Weakly Supervised Cell
Instance Segmentation by Propagating from Detection Response."
, In Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), pp.
649-657, China, October, 2019 (Top conference in medial image analysis, early
acceptance rate:16%).
[K. Nishimura+, MICCAI2019] [code]
- Junya Hayashida, Kazuya Nishimura and Ryoma Bise, " MPM: Joint
Representation of Motion and Position Map for Cell Tracking."
, In Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR), United States of America, June
2020
(Oral,Top Conference in Computer Vision, acceptance rate:22%, Oral:5%).[H.
Junya+, CVPR2020][code]
- Kazuya Nishimura and Ryoma Bise, “Weakly-Supervised Cell Tracking via
Backward-and-Forward Propagation”, In European Conference on Computer Vision (ECCV),
pp. 104-121, August,
2020(Top Conference in Computer Vision, acceptance rate:27%).
[K. Nishimura+, ECCV2020] [code]
- Kazuya Nishimura, Junya Hayashida, Chenyang Wang, Dai Fei Elmer Ker, Ryoma
Bise, “Spatial-Temporal Mitosis Detection in Phase-Contrast Microscopy via
Likelihood Map Estimation by 3DCNN”, In Engineering in Medicine and Biology Society
(EMBC 2020), Canada, July
2020.
[K. Nishimura+, EMBC2020] [code]
- Kazuya Nishimura, Hyeonwoo Cho and Ryoma Bise, "Semi-supervised Cell
Detection in Time-lapse Images Using Temporal Consistency"
, In Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), 2021
(Top conference in medial image analysis).
[K. Nishimura+, MICCAI2021] [code]
- Hyeonwoo Cho, Kazuya Nishimura, Kazuhide Watanabe, Ryoma Bise, "Cell
Detection in Domain Shift Problem Using Pseudo-Cell-Position Heatmap"
, In Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), 2021
(Top conference in medial image analysis).
[H. Cho+, MICCAI2021]
- Kazuma Fujii, Daiki Suehiro, Kazuya Nishimura, Ryoma Bise, "Cell Detection
from Imperfect Annotation by Pseudo Label Selection Using P-classification"
, In Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI), 2019
(Top conference in medial image analysis).
[K. Fujii+, MICCAI2021]
Others
- Kazuya Nishimura , Dai Fei Elmer Ker and Ryoma Bise, "Weakly supervised Cell
Segmentation."
, In Joint Workshop on Machine Perception and Robotics, Japan, November 2019
(Oral,Contribution award).
- Dan Wang, Xu Zhang, Kazuya Nishimura , Rocky Tuan, Ryoma Bise and Dai Fei Elmer
Ker, Label-Free Cell Detection in Phase Contrast Images Using Artificial Neural Networks
, Orthopaedic Research Society (ORS) Annual Meeting, March 2020 (Poster).
- Kazuya Nishimura, Dai Fei Elmer Ker and Ryoma Bise, "Deep learning for cell
segmentation with less annota-
tion", Resonance Bio International Symposium, October 2019 (Poster).
Presentations in domestic conference
- 西村 和也, Dai Fei Elmer Ker, 備瀬竜馬,"弱教師学習を用いた顕微鏡画像における細胞領域認識",
第22回画像の認識・理解シンポジウム,OS3A-1,大阪,2019年7月 (口頭発表,MIRU学生奨励賞受賞).
- 西村 和也,備瀬 竜馬, "顕微鏡画像における細胞セグメンテーション",電気・情報関係学会九州支部連合大会講演論文集,大分,2018年9月.
- 西村 和也,備瀬 竜馬, "弱教師学習を用いた顕微鏡画像における細胞領域認識手法の提案",細胞ダイバース第2回若手ワークショップ,仙台,2019年2月.
- 西村 和也,Dai Fei Elmer Ker,備瀬 竜馬,"弱教師学習を用いた複数細胞種における細胞領域認識", パターン認識・メディア理解研究会, 東京,信学技報,
vol. 119, no. 64, PRMU2019-9, pp. 271-275, 2019 年 5 月. (口頭発表)
- 西村 和也, Dai Fei Elmer Ker, 備瀬竜馬,"Deep Neural Network 解析による細胞領域認識用学習データ作成の省略化",
細胞ダイバース第4回公開シンポジウム, 神戸,2019年6月.
- 西村 和也,林田純弥,備瀬 竜馬,"時系列3D CNN回帰モデルによる細胞分裂認識", パターン認識・メディア理解研究会, 岡山,信学技報, vol. 119, no.
192, PRMU2019-22, pp. 57-61, 2019年9月 (口頭発表,PRMU月間ベストプレゼンテーション賞受賞).
- 西村 和也, Dai Fei Elmer Ker, 備瀬竜馬,"細胞社会ダイバース解析のための簡易なアノテーションを用いたトラッキング手法の提案",
細胞ダイバース第5回公開シンポジウム,東京,2020年1月.
- 西村和也, Dai Fei Elmer Ker, 備瀬竜馬,"細胞社会ダイバース解析のための簡易なアノテーションを用いた定量化手法の提案",
細胞ダイバース第3回若手ワークショップ,東京,2020年2月.
- 西村 和也, 林田純弥(九大), Ker Elmer, Wang Chenyang(香港中文大), 備瀬竜馬(九大),"弱教師学習に基づいた細胞追跡",
パターン認識・メディア理解研究会, オンライン,信学技報, vol. 120, no. 14, PRMU2020-4, pp. 19-22, 2020 年 5 月.
(口頭発表,PRMU月間ベストプレゼンテーション賞受賞)
- 西村 和也, 林田純弥(九大), Ker Elmer, Wang Chenyang(香港中文大), 備瀬竜馬(九大),"弱教師付き学習に基づいた細胞トラッキング",
第23回画像の認識・理解シンポジウム,OS1-1A-5,オンライン,2020年8月 (口頭発表,MIRU学生奨励賞受賞).
- 藤井 和磨, 西村 和也,林田 純弥,備瀬 竜馬, "深層学習を用いた3次元多細胞検出",電気・情報関係学会九州支部連合大会講演論文集,福岡,2020年9月.
- Cho Hyeonwoo, Kazuya Nishimura,Ryoma Bise, "Cell Detection for Various Cell
Shapes",電気・情報関係学会九州支部連合大会講演論文集,福岡,2020年9月.
- 林田 純弥,西村 和也,備瀬 竜馬,"大域的な時空間コンテキストの整合性を考慮した細胞トラッキング", パターン認識・メディア理解研究会, 社団法人 電子情報通信学会,
2020年10月9日.
- 林田 純弥,西村 和也,備瀬 竜馬,"細胞位置及び細胞対応付け同時学習CNNによる細胞追跡", パターン認識・メディア理解研究会, 社団法人電子情報通信学会, 2019
年 10月19日.
- Kazuya Nishimura, Hyeonwoo Cho and Ryoma Bise,"Cell detection in Time-Lapse Images via Tracking",
第24回画像の認識・理解シンポジウム,L3-3, オンライン,2021年7月 (口頭発表,MIRU学生奨励賞受賞).
- Hyeonwoo Cho, Kazuya Nishimura, Kazuhide Watanabe and Ryoma Bise,"Domain Extension in Cell Detection by Pseudo-Cell-Position Heatmap",
第24回画像の認識・理解シンポジウム,I12-08, オンライン,2021年7月 (ポスター発表).
- Kazuma Fujii, Kazuya Nishimura, Kazuhide Watanabe and Ryoma Bise,"Cell Detection for Imperfect Annotation Problem by using Top-Ranking for Pseudo-Labeling",
第24回画像の認識・理解シンポジウム,S4-6, オンライン,2021年7月 (口頭発表).
Awards
- CVPR 2019 Contest on Mitosis Detection in Phase Contrast Microscopy Image Sequences 2nd
place, Jun 2019, https://media.m2i.ac.cn/mitosisdetection/results/.
- PRMU Monthly Best Presentation Award, "時系列3D CNN回帰モデルによる細胞分裂認識",パターン認識・メディア理解研究会,2019 年 9 月.
- PRMU Monthly Best Presentation Award,"弱教師学習に基づいた細胞追跡", パターン認識・メディア理解研究会,May 2020.
- PRMU Mentership program Outstanding performance award,"Weakly-Supervised Cell Tracking via Backward-and-Forward Propagation", パターン認識・メディア理解研究会,令和 3年 5月.
- MIRU student encouragement award, "弱教師学習を用いた顕微鏡画像における細胞領域認識",画像の認識・理解シンポジウム,July 2019.
- MIRU student encouragement award,"弱教師付き学習に基づいた細胞トラッキング", 画像の認識・理解シンポジウム,August 2020.
- MPR contribution award, The 15th Joint Workshop on Machine Perception and Robotics,
Octorber 2019.
- 電子情報通信学会 九州支部 学術奨励賞, 2021.
- 第11回(令和2年度)九州大学大学院システム情報科学府 優秀学生表彰, 2021.
- 九州大学学生表彰規程における学生表彰, 2021.